Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms