Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms