Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R3HDM1Q15032 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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