Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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GPNMBQ14956 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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