Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FOXC1Q12948 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXC1Q12948 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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