Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATMP50440 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATMP50440 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATMP50440 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATMP50440 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATMP50440 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATMP50440 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATMP50440 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATMP50440 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATMP50440 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATMP50440 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATMP50440 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATMP50440 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATMP50440 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms