Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms