Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCF2P10911 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2P10911 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2P10911 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2P10911 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2P10911 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2P10911 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms