Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA1P0DJI8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA1P0DJI8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA1P0DJI8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA1P0DJI8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms