Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPHP4O75161 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPHP4O75161 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms