Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms