Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm20538F6Z9R1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms