Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CatipB9EKE5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatipB9EKE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms