Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc183A2AJB1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms