Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C18orf8Q96DM3 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms