Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms