Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms