Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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