Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDK4Q16654 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms