Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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CHD4Q14839 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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