Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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