Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFFO1Q0D2I5 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms