Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms