Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms