Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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