Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CFAP73A6NFT4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CFAP73A6NFT4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms