Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms