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| BRD3 | Q15059 | MRPL57P3-201 | ENST00000619218 | 176 nt | BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00850-201 | ENST00000629221 | 685 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL160286.3-201 | ENST00000569644 | 3294 nt | TSL 2 BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | VDAC2-214 | ENST00000543351 | 1424 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | MT-RNR2-201 | ENST00000387347 | 1559 nt | BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | MDN1-201 | ENST00000369393 | 18413 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | TC2N-202 | ENST00000360594 | 3751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007342.7-201 | ENST00000624610 | 2337 nt | BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | HYKK-206 | ENST00000569878 | 4097 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | ERVH48-1-201 | ENST00000447535 | 2790 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL121950.1-201 | ENST00000624993 | 2077 nt | BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | UGT2A1-206 | ENST00000514019 | 2376 nt | TSL 2 BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | SH2D1B-201 | ENST00000367929 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRL3-210 | ENST00000508946 | 4758 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.72 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP13A4-202 | ENST00000342695 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC123769.1-201 | ENST00000530992 | 3192 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR5AS1-202 | ENST00000641320 | 7860 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO1P7-201 | ENST00000419523 | 1542 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | TCF12-213 | ENST00000559703 | 1544 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01252-201 | ENST00000499291 | 3673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | MMP8-201 | ENST00000236826 | 3056 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF658-201 | ENST00000612867 | 4160 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL161912.4-201 | ENST00000623889 | 2468 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.33 | | |
| BRD3 | Q15059 | MMP12-201 | ENST00000571244 | 1874 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC125238.2-201 | ENST00000430003 | 1440 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AQP9-201 | ENST00000219919 | 3034 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR6P1-201 | ENST00000334632 | 954 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | PIH1D3-201 | ENST00000336387 | 993 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | NPM1-202 | ENST00000351986 | 1237 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA40.4-201 | ENST00000390971 | 128 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP5J-206 | ENST00000400099 | 492 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL5P19-201 | ENST00000404228 | 893 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | PLGLB1-202 | ENST00000409310 | 960 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00437-201 | ENST00000414161 | 791 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | MRPS21P5-201 | ENST00000417885 | 231 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC073508.1-201 | ENST00000428866 | 656 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590128.1-201 | ENST00000433407 | 286 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162726.1-201 | ENST00000436084 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL355870.1-201 | ENST00000448272 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009244.1-201 | ENST00000450566 | 258 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC245041.2-201 | ENST00000479781 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104825.1-201 | ENST00000503186 | 685 nt | TSL 3 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC040934.1-201 | ENST00000523101 | 513 nt | TSL 2 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | MGAT4C-206 | ENST00000552435 | 550 nt | TSL 4 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC089984.3-201 | ENST00000552838 | 363 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162632.2-201 | ENST00000553933 | 399 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091304.4-201 | ENST00000565703 | 620 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4312-201 | ENST00000579909 | 76 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005242.1-201 | ENST00000585658 | 438 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC243960.3-202 | ENST00000599770 | 594 nt | TSL 4 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | MILR1-203 | ENST00000615220 | 1196 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | N4BP2L2-204 | ENST00000399396 | 2872 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC25A30-204 | ENST00000519676 | 3670 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC012668.3-202 | ENST00000417485 | 1642 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLMN-201 | ENST00000298912 | 12747 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC105411.1-201 | ENST00000568776 | 1470 nt | TSL 4 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092451.3-201 | ENST00000625067 | 1343 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004656.1-201 | ENST00000568479 | 4951 nt | BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | TAF7L-203 | ENST00000372907 | 2341 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | CSNK1G1-204 | ENST00000606793 | 1658 nt | TSL 5 BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF432-202 | ENST00000594154 | 4513 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | DTNA-230 | ENST00000598334 | 3201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.71 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATXN7-208 | ENST00000484332 | 2741 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF268-205 | ENST00000536435 | 13475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ALG13-203 | ENST00000394780 | 4133 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | C9orf135-AS1-201 | ENST00000439418 | 1375 nt | TSL 2 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | VEZT-204 | ENST00000436874 | 4562 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC016907.2-203 | ENST00000455424 | 3563 nt | TSL 3 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF644-204 | ENST00000370440 | 5702 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH15-202 | ENST00000361849 | 7017 nt | TSL 5 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH15-205 | ENST00000373957 | 7032 nt | TSL 5 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121768.1-201 | ENST00000613917 | 2544 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | RIMS1-219 | ENST00000523963 | 3097 nt | TSL 2 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLCN3-201 | ENST00000347613 | 3635 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLAMF6-202 | ENST00000368057 | 2712 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATF3-201 | ENST00000336937 | 482 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD1C-201 | ENST00000363315 | 78 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRAV27-201 | ENST00000390457 | 425 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC003092.2-201 | ENST00000411946 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC097717.1-233 | ENST00000413557 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL18AP14-201 | ENST00000417685 | 526 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL645465.1-201 | ENST00000417765 | 642 nt | TSL 3 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL7AP14-201 | ENST00000424041 | 802 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121759.1-202 | ENST00000425746 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | BX119321.1-201 | ENST00000428912 | 797 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC023141.6-201 | ENST00000429418 | 337 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC003989.1-201 | ENST00000434569 | 565 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC074367.1-201 | ENST00000438685 | 1125 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | VNN3-210 | ENST00000450865 | 596 nt | TSL 4 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL450263.1-202 | ENST00000453199 | 643 nt | TSL 3 BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC236972.4-201 | ENST00000458091 | 963 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | UOX-201 | ENST00000471089 | 899 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL654P-201 | ENST00000479178 | 292 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL079303.1-201 | ENST00000486611 | 463 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022415.1-202 | ENST00000486612 | 523 nt | BASIC | 6.7 | □□□□□ -1.34 | | |