Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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