Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms