Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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