Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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