Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms