Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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