Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMPOP42166 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms