Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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