Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms