Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms