Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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