Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms