Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms