Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC023300.2-201ENST00000611006 612 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC245166.3-201ENST00000636897 257 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 KIF9-201ENST00000265529 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPP2R2B-205ENST00000394414 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PAK6-213ENST00000560346 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBPJ-208ENST00000504907 1682 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TMPRSS7-205ENST00000617607 2377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NLRP12-202ENST00000345770 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZMIZ2-203ENST00000413916 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GUCY1A3-204ENST00000455639 2631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AP1S2-202ENST00000380291 3492 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ABCC12-201ENST00000311303 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 STYX-201ENST00000354586 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BORA-206ENST00000613797 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BTN3A2-209ENST00000527422 1460 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FANCF-201ENST00000327470 4269 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MEGF11-202ENST00000395614 3423 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FAM149A-206ENST00000503432 2011 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C8B-205ENST00000535057 2289 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DCTN1-AS1-206ENST00000437991 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DGKA-201ENST00000331886 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HMGN3-AS1-201ENST00000604516 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02112-201ENST00000511616 1847 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LCN1P1-201ENST00000372031 505 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL355297.1-201ENST00000402808 388 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AGBL5-IT1-201ENST00000411862 339 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MRPS18BP1-201ENST00000414228 192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FRG2FP-203ENST00000422555 567 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL139246.3-201ENST00000424215 626 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL590483.1-201ENST00000441338 468 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL724P-201ENST00000461895 271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01605-202ENST00000519738 733 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AP003064.1-201ENST00000526045 590 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC117372.1-201ENST00000548633 620 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC104316.2-201ENST00000559049 326 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ELOCP2-201ENST00000566760 332 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02191-201ENST00000568036 518 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL823P-201ENST00000584886 295 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FAM95B1-210ENST00000591605 743 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CCDC65-201ENST00000266984 2084 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ALDH7A1-231ENST00000637206 2466 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C3orf20-203ENST00000435614 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CDK20-204ENST00000375883 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CREB3L4-201ENST00000271889 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MAP6-204ENST00000526740 1755 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CHRNB3-201ENST00000289957 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ARHGEF9-213ENST00000624210 1888 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HCP5B-201ENST00000630472 1889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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