Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms