Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms