Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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