Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP6Q3SY56 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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