Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SS18Q15532 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SS18Q15532 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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