Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AGBL4-204ENST00000371839 2947 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CD302-202ENST00000429078 3803 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC092681.2-201ENST00000565102 3044 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SMARCAL1-202ENST00000358207 3056 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HSPD1P5-201ENST00000511127 1720 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC008966.1-203ENST00000499459 3137 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC113607.1-201ENST00000427019 589 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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