Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXO1Q12778 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms