Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.6 ms