Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms